1、中西医比较研究。中西医结合是一门新的综合性学科，有许多问题还正在探索。正因为在探索的过程中，才有可能创造。中西医结合这一新兴的综合性学科，在目前有许多不成熟的方面，两套体系在理论上具有不可通约性，那么，中西医比较应该是中西医结合的重要内容。要从两种医学不同的文化背景，两种医学的源头及各自形成、发展的历史过程尤其是两种医学的当代形态及其发展趋势，进行多方位的比较；还要从两种医学的不同认知方式和临床思维进行方法论的比较等等。这种比较有助于对两种医学体系特质作深刻的把握，有助于从他者观点更好地理解自己，从而突出自身优势以更有效地进行优势互补和融合，中西医的比较同时也有助于扩展人们的视野，以推进医学科学的多元化发展。进行这样的比较是参与和更新人类生命科学建构的重要途径。中西医结合是在当今的全球化时代崛起的，全球化给中西医结合事业提供了难得的机遇，同时也提出了严峻的挑战。中西医的比较肩负着中西医两套理论体系的对话、沟通的使命，它不仅能在这种对话、沟通过程中启发人们的思考，努力探索中西医结合的途径，探寻中西医结合的具体运作方式，同时也将对中医理论的创新和西医科技发展中的困惑提供不可或缺的借鉴。比较方法已经不再是普通研究中的比较手段，它是全球化时代的一种思维方式用于学术研究的产物。比较学科已成为当代学术研究中最重要的一股力量，它在众多学科中正在迅速成长为一门“显学”。从20世纪90年代起，我们就有效地开展了一系列中西医比较研究。在90年代中后期，我们主编和参编了全国高校统编教材《中西医学史》以及《医学科技发展与社会》等，对本科生、研究生分别开设了不同层次的《中西医比较》选修课。为了进一步广泛深入地开展中西医比较研究，目前，我们正在着手编撰《中西医结合导论》教程。

2、利用多学科的交叉、渗透与融合探索中西医的结合点。我校是一所融汇西医、中医、理工及人文社科于一体的综合性医科大学，充分利用多学科的交叉、渗透与融合探索中西医的结合点，是我们的突出特色和显著优势。我们拥有各项配套的设施，积极地利用现代生物医学科技，促进了中西医结合的不断创新与发展。我校的许多部级、省部级科研项目和重点课题就都是围绕中西医结合创新这一目标展开的，并取得一系列丰硕成果。当前，分子生物学已广泛地渗透到医学科学研究的各个领域，学科分化越来越细，新的分支学科不断产生；随着研究在深度和广度的发展，各学科广泛交叉、渗透，新的边缘学科和交叉科学不断形成。这些都使人们有可能进一步向细胞、分子以及更深的层次发展，在微观上日益深入地认识各种疾病以及生命现象的本质。同时，人们认识现象本质的根本目的是为了解决问题，而每一个较大的问题都涉及到若干以至许多方面和领域，特别是现在人们需要解决的问题越来越复杂，因此利用多学科的交叉、渗透与融合探索中西医的结合点，将有可能成为医学科学发展突破口，又可以成为新学科的生长点。现代自然科学和技术科学理论和方法与医学的结合使医学获得日趋细微、高效、快速、精密和简便的手段和技术，从而极大地提高了医学研究和疾病防治的水平。现代生物医学科技的不断发展和广泛应用，必将揭示中西医结合防治疾病的作用规律和疗效机理，从而推动中西结合在理论上的创新与突破。我们积极利用现代生物医学科技，充分吸收中医、西医两种医学特长、发掘、整理研究、阐释中医药学的经验真知和理论精华，以提高临床疗效和学术水平为核心，以中西医结合基地建设为基础，以人才培养为重点，以研究中西医结合点为主线，积极探索，开拓创新，促进中西医结合医学的理论和学科内涵建设不断向纵深发展。

3、积极探索中医药复杂性系统科学研究方法，促进中西医结合。复杂系统的研究是当代科学的前沿。科学界普遍认为，复杂系统研究目前急需在具体研究领域里取得突破，科学工作者必须在具体的复杂科学问题的研究中应用和发展复杂系统科学的方法论，总结复杂系统运动的一般性规律。复杂系统科学问题与生命科学中大量的关键科学问题密切相关。生物，特别是人体，是公认的复杂系统。在现代生物医学研究中，还原论方法的局限性也已经暴露出来，整体观的重要性开始被科学界重新认识。而中医药理论体系与复杂系统论的思维方式非常相似。人们发现把复杂事物分解为基本组成单元，再用实验加上分析和推理的方法已经不能够解决所有的问题。以“还原论”为基础的西方医学界由于在解决许多复杂疾病方面一再受到挫折，逐渐出现了循证医学、系统生物学、系统医学等新兴学科。西方的科学和医学也开始探求整体论，从而与注重传统平衡的中医之间开辟了很多可以对话的渠道。中医强调整体论，西医则强调还原论，多年来许多学者认为两者格格不入，但事实证明，到了系统生物学时代，我们完全有可能找到共同语言。中医和现代医学在系统生物学的基础上进行整合将为医学的发展带来革命性的变化。如果能抓住这样一个趋势，就有可能创造出一个全新的以认识人体机理为基础的预防科学体系。所以我们认为，中医药与系统生物学结合形成具有我国特色的系统生物医学，将是一个极富创造性并可能引领中医药现代化的重要之举。在大量的中西医结合科研实践中，使我们深刻认识到：中医药现代化研究应立足于中医学基本理论如“证”、“藏象及病机”等整体论，以及中药复方的多层次、多靶点治疗的协同性和“方证”对应性，探索循证中医学研究的基本方法与可行性途径，尝试用“现代语言”诠释中医理论的科学性，开展以中医方剂为载体的“方证相关”内在规律、临床疗效及其作用机制等方面的探索研究，力求在中医药基础和临床研究的思路与方法上有所创新，在中医“病－证－方相关性”的基础研究方面形成特色与优势，推动现代医学向预测、预防和个体化的模式转化并为其提供新的科研思路和方法学，走出一条中西医结合和中医药现代化研究的新路。目前，我们正在着手进行以下几项工作：一是重视整合和整体性的研究，采用多学科交叉从细胞水平、动物模型、临床研究等多个层面上开展工作，并要善于将不同层面的研究结果进行整合；二是采用基因组学、蛋白质组学、代谢组学等生物技术进行研究，其中代谢组学由于更能整体性地反映研究对象的病理和生理状态而将成为一种主要研究手段；三是注重生物信息学，因为数据的整合和整体性、系统性的研究和评价都要借助于生物信息学的应用，中医生物信息学将在中医药现代化研究中扮演重要的角色；四是应积极开展人体微生态包括肠道菌群的代谢和变化的研究，这个领域将在中医药现代化研究中成为一个热点；五是注重中医理论指导下的复方中药研究，中药的研究重点将从单味药、单体、单个活性部位逐渐转到复方和合理配伍的活性部位群上来，中药药效和临床疗效的评价将出现更能反映整体调控和平衡的新方法和新标准。

4、加强中西医结合科普创作，拓宽中西医结合工作的广度。近年来，我校专家、学者创作了不少中西医结合的科普作品，在社会上产生了良好的影响。这些作品使广大群众初步了解了中西医结合工作的意义、内容、性质以及中西医结合的方向和未来。这些作品通俗易懂，切合实用，从中西医结合角度普及了人类健康卫生和防病治病的科学知识，受到社会大众热烈的欢迎。它不仅是中西医结合工作在面上的扩张，同时也是研究视角多样化的体现，表征了中西医结合医学强大的生命力。